Нашел два решения:
1.
redirectclipboard:i:1
redirectposdevices:i:0
redirectprinters:i:0
redirectcomports:i:1
redirectsmartcards:i:1
devicestoredirect:s:*
drivestoredirect:s:*
redirectdrives:i:1
session bpp:i:16
prompt for credentials on client:i:1
span monitors:i:0
use multimon:i:0
remoteapplicationmode:i:1
server port:i:3389
allow font smoothing:i:0
promptcredentialonce:i:1
authentication level:i:2
full address:s:192.168.0.200
remoteapplicationprogram:s:||1cfull
remoteapplicationname:s:1cfull
remoteapplicationcmdline:s:
alternate full address:s:SERVERNAME
disableremoteappcapscheck:i:1
alternate shell:s:rdpinit.exe
screen mode id:i:2
winposstr:s:0,3,0,0,800,600
compression:i:0
keyboardhook:i:2
audiocapturemode:i:0
videoplaybackmode:i:1
connection type:i:2
disable wallpaper:i:1
allow desktop composition:i:1
disable full window drag:i:1
disable menu anims:i:1
disable themes:i:1
disable cursor setting:i:1
bitmapcachepersistenable:i:0
audiomode:i:0
redirectdirectx:i:0
autoreconnection enabled:i:1
prompt for credentials:i:0
negotiate security layer:i:1
remoteapplicationicon:s:
shell working directory:s:
gatewayhostname:s:
gatewayusagemethod:i:4
gatewaycredentialssource:i:4
gatewayprofileusagemethod:i:0
use redirection server name:i:0
networkautodetect:i:1
bandwidthautodetect:i:1
displayconnectionbar:i:1
enableworkspacereconnect:i:0
gatewaybrokeringtype:i:0
rdgiskdcproxy:i:0
kdcproxyname:s:
2.
1. Использовать RDP client 7 версии
2. установка hkcu\control panel\desktop\forgroundlocktimeout в 0
3. (возможно хуже не будет) установка указанных выше патчей и на сервер и на клиентов.
и есть способы отобразить все же пропавшие окна
1 способ Alt+tab — не всегда помогает
2 способ Ctrl+alt+esc — не всегда помогает
3 способ ctrl+alt+end и нажать отмена — помогает.
Посмотрю сегодня, что работает.
====================================
Помогает поднятие версии RDP до 8.1
https://www.microsoft.com/ru-RU/download/details.aspx?id=41036
Если пройти по ссылке выше, то ссылки на обновление не работают, поэтому ставим обновления:
KB2574819, KB2830477, KB2857650, KB2913751
https://www.microsoft.com/ru-RU/download/details.aspx?id=40986 -x64